| 順位 | 氏名 | 学年 | 記録 | 大会名 | 会場 | 日付 |
| 1 | 西尾 文吾 | 4 | 3'51"07 | 第2回土曜競技会 | 中京大 | 2016/5/21 |
| 2 | 岸田 裕也 | 4 | 3'55"95 | 第71回京都選手権 | 西京極 | 2016/7/16 |
| 3 | 國司 寛人 | M1 | 3'57"26 | 名阪戦 | 服部緑地 | 2016/5/28 |
| 4 | 池亀 透 | D1 | 4'00"91 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |
| 5 | 福田 拓弥 | 4 | 4'03"50 | 第4回土曜競技会 | 中京大 | 2016/8/6 |
| 6 | 遠藤 暢 | 3 | 4'03"56 | 七大戦 | 大井ふ頭 | 2016/7/31 |
| 7 | 河上 匠 | 2 | 4'03"93 | 七大戦 | 大井ふ頭 | 2016/7/31 |
| 8 | 塚本 亮司 | 1 | 4'05"67 | 豊橋市民陸上 | 豊橋 | 2016/8/7 |
| 9 | 鈴木 健弘 | 2 | 4'07"61 | 名阪戦 | 服部緑地 | 2016/5/28 |
| 10 | 伊藤 無限 | M1 | 4'08"07 | 東海学生春季 | 知多 | 2016/4/10 |
| 11 | 砂原 健汰 | 3 | 4'08"78 | 一橋戦 | 一橋大 | 2016/10/1 |
| 12 | 森 信人 | 1 | 4'09"44 | 東海学生秋季 | 長良川 | 2016/10/9 |
| 13 | 戸叶 貴也 | 2 | 4'10"41 | 第2回土曜競技会 | 中京大 | 2016/5/21 |
| 14 | 浮津 照也 | 2 | 4'12"68 | 東海学生春季 | 知多 | 2016/4/10 |
| 15 | 柴田 雄斗 | 2 | 4'13"08 | 名阪戦 | 服部緑地 | 2016/5/28 |
| 16 | 小松 遼矢 | 1 | 4'13"65 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |
| 17 | 萩原 諒 | 2 | 4'13"95 | 名古屋地区選手権 | 瑞穂北 | 2016/10/15 |
| 18 | 松永 幸大 | 3 | 4'15"85 | 第2回静岡競技会 | エコパ | 2016/6/25 |
| 19 | 紀藤 大樹 | 1 | 4'17"01 | 一橋戦 | 一橋大 | 2016/10/1 |
| 20 | 藤原 昌平 | 4 | 4'17"73 | 第6回土曜競技会 | 中京大 | 2016/10/29 |
| 21 | 佐藤 健太郎 | M1 | 4'18"50 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |
| 22 | 藤原 雄太 | 1 | 4'19"08 | 東海学生秋季 | 長良川 | 2016/10/9 |
| 23 | 岩井 宏樹 | 2 | 4'19"27 | 第1回土曜競技会 | 中京大 | 2016/4/16 |
| 24 | 斎藤 幹俊 | 1 | 4'19"66 | 一橋戦 | 一橋大 | 2016/10/1 |
| 25 | 中野 圭 | 2 | 4'20"59 | 伊勢崎ナイター | 伊勢崎 | 2016/7/9 |
| 26 | 小川 瑞貴 | 1 | 4'20"97 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |
| 27 | 松田 克洋 | 1 | 4'22"50 | 一橋戦 | 一橋大 | 2016/10/1 |
| 28 | 清水 貴也 | 1 | 4'22"99 | 第4回土曜競技会 | 中京大 | 2016/8/6 |
| 29 | 降旗 賢人 | 3 | 4'23"09 | 信大戦 | 知多 | 2016/5/4 |
| 30 | 上寺 啓太 | 4 | 4'24"27 | 信大戦 | 知多 | 2016/5/4 |
| 31 | 飯田 康平 | 2 | 4'26"40 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |
| 32 | 森長 真言 | 3 | 4'27"30 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/5/28 |
| 33 | 千葉 俊季 | 3 | 4'27"68 | 一橋戦 | 一橋大 | 2016/10/1 |
| 34 | 木村 健太郎 | 2 | 4'28"22 | 一橋戦 | 一橋大 | 2016/10/1 |
| 35 | 大越 拓実 | 3 | 4'28"70 | 名阪戦 | 服部緑地 | 2016/5/28 |
| 松井 佑輔 | 3 | 4'28"70 | 第1回名古屋地区 | 瑞穂北 | 2016/4/2 | |
| 37 | 岡部 弘幸 | M1 | 4'35"74 | 伊勢崎ナイター | 伊勢崎 | 2016/7/9 |
| 38 | 山田 剛大 | 1 | 4'38"85 | 一橋戦 | 一橋大 | 2016/10/1 |
| 39 | 清水 康仁 | 3 | 4'39"42 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |
| 40 | 茂田 孝弘 | 1 | 4'39"84 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |
| 41 | 竹原 佑亮 | 2 | 4'42"83 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |
| 42 | 伊藤 公太 | 1 | 4'55"86 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |
| 43 | 近藤 利哉 | 1 | 5'00"88 | 七大戦OP | 大井ふ頭 | 2016/7/30 |